12 سؤال وجواب في وحدة بنية ووظيفة البروتين
.
1- فيما يستعمل البرنامج راستوب؟ يستعمل في تمثيل البنية الفراغية للجزيئات مثل الأحماض الأمينية والبروتينات.
.
2- ما هي الأحماض الأمينية؟ وما هي أهم مميزاتها؟ هي مركبات عضوية تشكل البروتينات، صيغتها العامة R-CHNH2-COOH، حيث الجذر R جزء متغير. من أهم مميزاتها الخاصية الأمفوتيرية (الحمقلية) ونقطة التعادل الكهربائي pHi.
.
3- ما الفرق بين الـ 20 حمض أميني المشكلة للبروتينات؟ تختلف في السلسلة الجانبية (الجذر R).
.
4- كيف تصنف الأحماض الأمينية؟ تصنف حسب الجذر R إلى: متعادلة، حمضية وقاعدية.
.
5- ماذا نقصد بالخاصية الأمفوتيرية؟ نقصد بها أن نفس الحمض الأميني يمكن أن يسلك سلوكين، سلوك الحمض في الوسط القاعدي، وسلوك القاعدة في الوسط الحمضي.
.
6- ماذا نقصد بنقطة التعادل الكهربائي (pHi)؟ هي درجة حموضة الوسط التي يكون فيها الحمض الأميني متعادل كهربائيا (محصلة شحنته معدومة).
.
7- ماذا نقصد بسلوك الحمض الأميني؟ هجرته في شريط الفصل.
.
8- كيف نحدد سلوك الحمض الأميني؟ نقارن بين pH الوسط والـ pHi الخاصة بالحمض الأميني، فنميز ثلاث حالات:
ـ H>pHi: يسلك الحمض الأميني سلوك الحمض (يفقد H+)، يكتسب شحنة سالبة (-) ويهاجر نحو القطب الموجب (+).
ـ pH<pHi: يسلك الحمض الأميني سلوك القاعدة (يكتسب H+)، يكتسب شحنة موجبة (+) ويهاجر نحو القطب السالب (-).
ـ pH=pHi: الحمض الأميني في حالة متعادلة مع الوسط (لا يفد ولا يكتسب بروتونا) وبالتالي لا يهاجر إلى أي من القطبين.
.
9- كيف ترتبط الأحماض الأمينية؟ بواسطة رابطة ببتيدية، تتشكل من ارتباط مجموعة الكربوكسيل للحمض الأميني الأول ومجموعة الأمين للحمض الأميني الثاني وتحرر جزيئة ماء.
.
10- لماذا يتميز كل بروتين ببنية خاصة؟ لأن كل بروتين يتميز بعدد ونوع وترتيب خاص من الأحماض الأمينية.
.
11- كيف يكتسب البروتين بنيته الفراغية؟ تلتف السلسلة الببتيدية تلقائيا بفضل الروابط الكيميائية التي تنشأ بين الأحماض الأمينية في مواضع معينة، فتكتسب بنية فراغية متميزة ومستقرة وتصبح بروتينا وظيفيا.
.
12- ما هي الروابط المساهمة في استقرار بنية البروتين؟ وكيف تتوضع؟ أربعة أنواع: هيدروجينية، شاردية، تجاذب الجذور الكارهة للماء وجسر ثنائي الكبريت. تتوضع بين السلاسل الجانبية للأحماض الأمينية.
13- ما الغرض من استعمال تقنية الهجرة الكهربائية؟ هو فصل الأحماض الأمينية المتواجدة في نفس المحلول حسب شحنتها.