اسباب المشاكل داخل المساجد ترجع الى عدة امور
01-المستوى الثقافي والتعليمي المتدني لكثير من الائمة
02-نوعية الحي او القرية التي يقع بها المسجد
03-عدم تعيين ايمة رسميين يجعل التنازع يزداد حول الامامة والاذان
04-وصول بعض رؤساء لجان المسجد بطرق غير سوية
05-عدم قيام المفتش بدوره في كثير من الاحيان
06-دخول جماعات دينية تحت مسميات مختلفة في الصراع
07-ضعف التكوين في تسيير التبرعات والاموال من الناحية الشرعية والقانونية
08-انتقال فقه النصيحة في المجتمع والمساجد من التلميح الى التجريح والميل الى التشهير واثارة الفتن