L'asepsie désigne le fait de prévenir les maladies infectieuses en empêchant la contamination par des bactéries, des microbes, des parasites ou d'autres germes d'une zone déterminée. Elle a pour objectif de réduire la prolifération d'agents pathogènes et la transmission de virus. L'asepsie consiste en la décontamination de l'espace, y compris de l'air, du matériel, et l'utilisation d'antiseptiques sur la surface du corps. L'asepsie est totale en chirurgie ou dans les chambres stériles. Le défaut d'asepsie peut provoquer la pénétration de micro-organismes dans l'organisme notamment lors d'interventions chirurgicales et engendrer de graves infections.
L'antisepsie est une technique, effectuée à base de produits antiseptiques, permettant d'éliminer de manière transitoire l'ensemble des micro-organismes présents sur le corps. L'antisepsie a permis de réduire de manière très significative le nombre de décès dus à des infections, que ce soit suite à des opérations ou suite à des accouchements. L'antisepsie date seulement de la fin du XIXe siècle. Elle ne préserve pas la flore endémique, contrairement à l'asepsie qui empêche l'apport de nouveaux germes.