الرابطة الببتيدية تنشأ بين حمضين أمينيين و بالتحديد بين المجموعة الكربوكسيلية (الحمضية) للحمض الأميني الأول و المجموعة القاعدية (الأمينية) للحمض الأميني الثاني
nh2_ ch_ cooh_ nh2 _ch _cooh
تصبح nh2_ ch _conh_ ch _cooh
و تتحرر جزيئة ماء عن كل رابظة ببتيدية