〆 بٰٰاولو 乄
2017-07-04, 11:06
سلاااامو
ملاحظة
قبل مانبداو : جيبوا معاكم الكتاب ولي معندوش يشري
ولي معندوش مسكين زوالي ( gليل ) :D
ها تفضل رابط تحميل الكتاب :
https://eddirasa.com/wp-*******/uploads/livre_scolaire_3as_science_sci_PDF.zip
كلمة سر الملف : eddirasa.com
بسم الله
نبداو على بركة الله
تمثيل البنية الفراغية للبروتين
تمثيل البنية الفراغية للجزيئات البسيطة:
يمكن تمثيلها بعدة نماذج أهمها:
* نموذج الكرة والعود (Bâtonnets et Boules) :
يهدف الى اظهار الذرات والروابط الموجودة فيما بينها.
* نموذج الكرة او المكدس (Sphères) :
إظهار حجم الجزيئة وتظهر الذرات فقط.
* نموذج العود ( Bâtonnets ) :
إظهار الروابط الكيميائية في الجزيئة.
* نموذج الخيط الحديدي ( fer de Fil ) :
يبين الروابط وتكون على شكل خيط رقيق.
نماذج مختلفة لتمثيل بنية حمض أميني: الوثيقة ( 1 )ص40.
تمثيل البنية الفراغية للجزيئات الكبيرة :
يمكن تمثيلها بنفس النماذج السابقة باإلضافة الى نماذج أخرى
تسمح بتوضيح جوانب أخرى من البنية الفراغية وهي:
* الشريطي(Rubans ) و الشريطي السميك ( Caricatures) :
يسمح بتوضيح البنيات الثانوية للجزيئة حيث تظهر البنيات
الحلزونية خ± على شكل شريط حلزوني وردي اللون، بينما البنيات
الوريقية خ² تظهر بشكل وريقات مطوية بلون أصفر، كما يسمح
بإظهار مناطق االنعطاف في شكل خيط سميك أبيض أو أزرق.
- نماذج مختلفة لتمثيل بنية بروتين: الوثيقة (2 ) ص41.
مميزات برنامج Rastop في دراسة البروتينات :
- عرض البنية الفراغية ثالثية األبعاد للجزيئات بنماذج مختلفة.
- دراسة البنية الثانوية بتحديد عددها ونوعها في البروتين.
- تحديد عدد السالسل الببتيدية المكونة للبروتين.
- تحديد عدد ونوع وتسلسل األحماض األمينية في البروتين.
- تحديد الجزء البروتيني والجزء غير البروتيني في الجزيئات.
- التعرف على الموقع الفعال للبروتين.
- التعرف على مختلف الروابط التي تساهم في ثبات البنية
( روابط هيدروجينية، جسور كبريتية..... )
مستويات البنية الفراغية لبروتينات :
- تتميز البنية الفراغية البروتينات بالتعقيد وتختلف درجته بين
البروتينات ويمكن وصف 4 مستويات بنيوية متدرجة التعقيد هي:
البنية الأولية :
- ارتباط أحماض أمينية بروابط ببتيدية لتكوين سلسلة ببتيدية
بدايتها NH2 ونهايتها COOH.
مميزات البنية األولية : الوثيقة (1 ) ص42
البنية الثانوية :
- هي التفاف البنية األولية في مناطق محددة في شكل بنيات
حلزونية خ± أو بنيات وريقية خ² وهذا بتشكل روابط هيدروجينية
بين NH وCO التابعة للروابط الببتيدية.
- مميزات البنية الثانوية: الوثيقة (2 )ص42.
البنية الثالثية:
- هي انطواء البنية الثانوية على مستوى مناطق االنعطاف لتأخذ
بنية فراغية محددة تحافظ على ثباتها بروابط مختلفة
(كبريتية،شاردية، هيدروجينية، تجاذب الجذور الكارهة للماء).
- مميزات البنية الثالثية: الوثيقة ( 3 )ص43
البنية الرابعية :
-هي ارتباط سلسلتين ببتيديتين أوأكثر بروابط ضعيفة تحافظ على
استقرارها لكل منها بنية ثالثية وتسمى كل واحدة "تحت الوحدة"
- مميزات البنية الرابعية: الوثيقة (4 ) ص44
العلاقة بين بنية ووظيفة البروتين :
- إن اختالف البنية الفراغية للبروتينات يعود الى اختالف عدد
ونوع وترتيب األحماض األمينية الداخلة في تركيبها.
تعريف الأحماض الأمينية :
- هي جزيئات بسيطة تمثل الوحدة البنائية األساسية للبروتينات،
وهي مركبات عضوية مقسمة الى جزأين:
* جزء ثابت:
يتكون من وظيفة أمينية (NH2 )
ووظيف ةكربوكسيلية (COOH ) متصلتين بذرة كربون مركزية (Cخ± )
التي تتصل أيضا مع (H )
وهو موجود عند جميع الأحماض الأمينية
* جزء متغير:
يتمثل في سلسلة جانبية أو جذر ألكيلي يرمز له
(R) ويختلف تركيبه من حمض أميني الأخر
تصنيف الأحماض الأمينية :
يمكن تصنيفها حسب الجزء المتغير ( الجذر R )إلى 3 أصناف:
* أحماض أمينية حامضية:
يحتوي الجذر على مجموعة حمضية (COOH )عددها 2 هي:
غلوتاميك (Glu ) وأسبارتيك (Asp)
* أحماض أمينية قاعدية :
يحتوي الجذر على مجموعة أمينية(NH2 )عددها 3 وهي:
ليزين(Lys ) أرجينين (Arg) هيستدين (His)
* أحماض أمينية متعادلة:
تمتاز بعدم وجود مجموعة حمضية أو قاعدية في الجذر R
وعددها 15 يمكن تقسيمها حسب نوع الوظائف الموجودة في
جذورها الى:
كحولية، عطرية، كبريتية، أليفاتية، أميدية، حلقية.
تشكل الرابطة الببتيدية بين الأحماض الأمينية :
هي رابطة تكافؤية قوية تتشكل بين المجموعة الكربوكسيلية
للحمض األميني األول والمجموعة األمينية للحمض األميني
الموالي مع انطالق جزيء من الماء.
سلوك الأحماض الأمينية في الوسط :
- يتغير سلوك الحمض األميني بتغير درجة pH الوسط، وهجرته
في المجال الكهربائي تعتمد على نوع الشحنة التي يكتسبها.
- تسلك األحماض األمينية سلوك األحماض( تفقد بروتونات)
في الوسط القاعدي وتسلك سلوك القواعد ( تكتسب بروتونات)
في الوسط الحامضي لذلك تسمى بالمركبات الأمفوتيرية (الحمقلية)
القاعدة التي تسمح بتحديد شحنة الحمض األميني:
-تعريف نقطة التعادل الكهربائي (PHi)
هي قيمة يكون عندها الحمض األميني متعادل كهربائيا، عدد
الشحنات الموجبة والسالبة متساوي أي شحنة معدومة (0)
- PH=PHi شحنة الحمض األميني معدومة (0) :
- ال يهاجر الى أي قطب ( يبقى في المنتصف ) ويدل على تساوي
الشحنات (+) و(-) أي تأين الوظيفة األمينية
( +NH3 ) والحمضية
( - COO ) ومنه يسلك سلوك حمض وقاعدة في نفس الوقت
- PH>PHi شحنة الحمض األميني موجبة (+) :
- يهاجر الى القطب (-) ويدل على اكتسابه بروتون
(+H ) من الوسط
وتأين الوظيفة الأمينية ومنه يسلك سلوك قاعدة في وسط حامضي
- PH<PHi شحنة الحمض األميني سالبة (-) :
- يهاجر الى القطب (+) ويدل على فقدانه بروتون
(+H ) من الوسط
وتأين الوظيفة الحمضية ومنه يسلك سلوك حمض في وسط قاعدي
- القاعدة التي تحدد قيمة PHi التقريبية لألحماض األمينية :
* الأحماض الأمينية المتعادلة : لها PHi قريب من المعتدل.
* الأحماض الأمينية الحامضية : لها PHi أقل من المعتدل.
* الأحماض الأمينية القاعدية : لها PHi أكبر من المعتدل.
دوك نحطلكم الصيغة العامة للأحماض الأمينية و كيفية تشكيل الرابطة البيبتيدية
على شكل صور باه تفهموا بياا
يتبع ....
ملاحظة
قبل مانبداو : جيبوا معاكم الكتاب ولي معندوش يشري
ولي معندوش مسكين زوالي ( gليل ) :D
ها تفضل رابط تحميل الكتاب :
https://eddirasa.com/wp-*******/uploads/livre_scolaire_3as_science_sci_PDF.zip
كلمة سر الملف : eddirasa.com
بسم الله
نبداو على بركة الله
تمثيل البنية الفراغية للبروتين
تمثيل البنية الفراغية للجزيئات البسيطة:
يمكن تمثيلها بعدة نماذج أهمها:
* نموذج الكرة والعود (Bâtonnets et Boules) :
يهدف الى اظهار الذرات والروابط الموجودة فيما بينها.
* نموذج الكرة او المكدس (Sphères) :
إظهار حجم الجزيئة وتظهر الذرات فقط.
* نموذج العود ( Bâtonnets ) :
إظهار الروابط الكيميائية في الجزيئة.
* نموذج الخيط الحديدي ( fer de Fil ) :
يبين الروابط وتكون على شكل خيط رقيق.
نماذج مختلفة لتمثيل بنية حمض أميني: الوثيقة ( 1 )ص40.
تمثيل البنية الفراغية للجزيئات الكبيرة :
يمكن تمثيلها بنفس النماذج السابقة باإلضافة الى نماذج أخرى
تسمح بتوضيح جوانب أخرى من البنية الفراغية وهي:
* الشريطي(Rubans ) و الشريطي السميك ( Caricatures) :
يسمح بتوضيح البنيات الثانوية للجزيئة حيث تظهر البنيات
الحلزونية خ± على شكل شريط حلزوني وردي اللون، بينما البنيات
الوريقية خ² تظهر بشكل وريقات مطوية بلون أصفر، كما يسمح
بإظهار مناطق االنعطاف في شكل خيط سميك أبيض أو أزرق.
- نماذج مختلفة لتمثيل بنية بروتين: الوثيقة (2 ) ص41.
مميزات برنامج Rastop في دراسة البروتينات :
- عرض البنية الفراغية ثالثية األبعاد للجزيئات بنماذج مختلفة.
- دراسة البنية الثانوية بتحديد عددها ونوعها في البروتين.
- تحديد عدد السالسل الببتيدية المكونة للبروتين.
- تحديد عدد ونوع وتسلسل األحماض األمينية في البروتين.
- تحديد الجزء البروتيني والجزء غير البروتيني في الجزيئات.
- التعرف على الموقع الفعال للبروتين.
- التعرف على مختلف الروابط التي تساهم في ثبات البنية
( روابط هيدروجينية، جسور كبريتية..... )
مستويات البنية الفراغية لبروتينات :
- تتميز البنية الفراغية البروتينات بالتعقيد وتختلف درجته بين
البروتينات ويمكن وصف 4 مستويات بنيوية متدرجة التعقيد هي:
البنية الأولية :
- ارتباط أحماض أمينية بروابط ببتيدية لتكوين سلسلة ببتيدية
بدايتها NH2 ونهايتها COOH.
مميزات البنية األولية : الوثيقة (1 ) ص42
البنية الثانوية :
- هي التفاف البنية األولية في مناطق محددة في شكل بنيات
حلزونية خ± أو بنيات وريقية خ² وهذا بتشكل روابط هيدروجينية
بين NH وCO التابعة للروابط الببتيدية.
- مميزات البنية الثانوية: الوثيقة (2 )ص42.
البنية الثالثية:
- هي انطواء البنية الثانوية على مستوى مناطق االنعطاف لتأخذ
بنية فراغية محددة تحافظ على ثباتها بروابط مختلفة
(كبريتية،شاردية، هيدروجينية، تجاذب الجذور الكارهة للماء).
- مميزات البنية الثالثية: الوثيقة ( 3 )ص43
البنية الرابعية :
-هي ارتباط سلسلتين ببتيديتين أوأكثر بروابط ضعيفة تحافظ على
استقرارها لكل منها بنية ثالثية وتسمى كل واحدة "تحت الوحدة"
- مميزات البنية الرابعية: الوثيقة (4 ) ص44
العلاقة بين بنية ووظيفة البروتين :
- إن اختالف البنية الفراغية للبروتينات يعود الى اختالف عدد
ونوع وترتيب األحماض األمينية الداخلة في تركيبها.
تعريف الأحماض الأمينية :
- هي جزيئات بسيطة تمثل الوحدة البنائية األساسية للبروتينات،
وهي مركبات عضوية مقسمة الى جزأين:
* جزء ثابت:
يتكون من وظيفة أمينية (NH2 )
ووظيف ةكربوكسيلية (COOH ) متصلتين بذرة كربون مركزية (Cخ± )
التي تتصل أيضا مع (H )
وهو موجود عند جميع الأحماض الأمينية
* جزء متغير:
يتمثل في سلسلة جانبية أو جذر ألكيلي يرمز له
(R) ويختلف تركيبه من حمض أميني الأخر
تصنيف الأحماض الأمينية :
يمكن تصنيفها حسب الجزء المتغير ( الجذر R )إلى 3 أصناف:
* أحماض أمينية حامضية:
يحتوي الجذر على مجموعة حمضية (COOH )عددها 2 هي:
غلوتاميك (Glu ) وأسبارتيك (Asp)
* أحماض أمينية قاعدية :
يحتوي الجذر على مجموعة أمينية(NH2 )عددها 3 وهي:
ليزين(Lys ) أرجينين (Arg) هيستدين (His)
* أحماض أمينية متعادلة:
تمتاز بعدم وجود مجموعة حمضية أو قاعدية في الجذر R
وعددها 15 يمكن تقسيمها حسب نوع الوظائف الموجودة في
جذورها الى:
كحولية، عطرية، كبريتية، أليفاتية، أميدية، حلقية.
تشكل الرابطة الببتيدية بين الأحماض الأمينية :
هي رابطة تكافؤية قوية تتشكل بين المجموعة الكربوكسيلية
للحمض األميني األول والمجموعة األمينية للحمض األميني
الموالي مع انطالق جزيء من الماء.
سلوك الأحماض الأمينية في الوسط :
- يتغير سلوك الحمض األميني بتغير درجة pH الوسط، وهجرته
في المجال الكهربائي تعتمد على نوع الشحنة التي يكتسبها.
- تسلك األحماض األمينية سلوك األحماض( تفقد بروتونات)
في الوسط القاعدي وتسلك سلوك القواعد ( تكتسب بروتونات)
في الوسط الحامضي لذلك تسمى بالمركبات الأمفوتيرية (الحمقلية)
القاعدة التي تسمح بتحديد شحنة الحمض األميني:
-تعريف نقطة التعادل الكهربائي (PHi)
هي قيمة يكون عندها الحمض األميني متعادل كهربائيا، عدد
الشحنات الموجبة والسالبة متساوي أي شحنة معدومة (0)
- PH=PHi شحنة الحمض األميني معدومة (0) :
- ال يهاجر الى أي قطب ( يبقى في المنتصف ) ويدل على تساوي
الشحنات (+) و(-) أي تأين الوظيفة األمينية
( +NH3 ) والحمضية
( - COO ) ومنه يسلك سلوك حمض وقاعدة في نفس الوقت
- PH>PHi شحنة الحمض األميني موجبة (+) :
- يهاجر الى القطب (-) ويدل على اكتسابه بروتون
(+H ) من الوسط
وتأين الوظيفة الأمينية ومنه يسلك سلوك قاعدة في وسط حامضي
- PH<PHi شحنة الحمض األميني سالبة (-) :
- يهاجر الى القطب (+) ويدل على فقدانه بروتون
(+H ) من الوسط
وتأين الوظيفة الحمضية ومنه يسلك سلوك حمض في وسط قاعدي
- القاعدة التي تحدد قيمة PHi التقريبية لألحماض األمينية :
* الأحماض الأمينية المتعادلة : لها PHi قريب من المعتدل.
* الأحماض الأمينية الحامضية : لها PHi أقل من المعتدل.
* الأحماض الأمينية القاعدية : لها PHi أكبر من المعتدل.
دوك نحطلكم الصيغة العامة للأحماض الأمينية و كيفية تشكيل الرابطة البيبتيدية
على شكل صور باه تفهموا بياا
يتبع ....